该报告认为，从实施4年多的效果看，由于化肥商业淡季储备制度以企业储备、政府贴息、市场运作、自负盈亏为原则，经营性、市场化特征比较明显。另外，与企业自身利益直接挂钩的集中招标、集中收储方式也容易引发市场的异常波动。遇到今年化肥市场这样的巨大波动，商业储备无法有效抑制肥价上涨。而中央化肥储备不仅可以保证化肥充足供应，而且政府可以掌控化肥价格。此外，建立中央化肥储备制度也可以稳定生产企业的市场预期，降低生产企业库存积压的风险，提高化肥生产的连续性和稳定性，有利于防止企业停产损失，稳定产量，解除生产企业的后顾之忧。同时，进入国家储备库的化肥，又可以成为国家调节市场供求、引导市场价格的重要砝码，从而起到维护化肥市场稳定的作用。
报告还建议，为了稳定粮食主产区的化肥市场，达到建立中央化肥储备制度的目的，储备地点应主要选择在粮食主产区，保证国家粮食主产区化肥市场稳定。储备库建设可以依托当地现有的仓库系统，采取改造、新建和租赁3种方式。储备库建设和改造资金由中央财政全额负担，每年的银行贷款利息、储备库租赁费、运营成本及管理费用等也由中央财政全额补贴。
但是，这一报告所持观点也遭到了反对。有人认为，该报告提出的中央化肥储备带有浓厚的计划经济色彩，与国家坚持市场化改革的方向不符。国家发改委经贸司吴君扬博士在接受媒体访问时明确表示，化肥市场化的方向是非常明确的：走市场化的道路，让市场在资源配置中发挥基础性作用。计划经济已经证明有很多弊端，市场经济的方向不会变。
